Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
NRF1Q16656 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms