Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NPTX1Q15818 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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