Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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