Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL19A1Q14993 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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