Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
GBX1Q14549 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GBX1Q14549 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms