Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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