Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDX39BQ13838 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDX39BQ13838 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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