Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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