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| NAE1 | Q13564 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | DEUP1-201 | ENST00000298050 | 2664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | DEUP1-202 | ENST00000525646 | 1920 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | NOC3L-201 | ENST00000371361 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | NEB-203 | ENST00000397345 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | NEB-209 | ENST00000427231 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | OXR1-215 | ENST00000531443 | 3599 nt | TSL 5 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU4-79P-201 | ENST00000362764 | 141 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AL359853.2-201 | ENST00000442108 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL109933.2-201 | ENST00000452651 | 260 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP000705.1-201 | ENST00000454567 | 350 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |