Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NEUROD1Q13562 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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