Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TCIRG1Q13488 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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