Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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