Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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