Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms