Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CSTF3Q12996 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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