Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
IFFO1Q0D2I5 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms