Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HOXD13P35453 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD13P35453 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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