Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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PTPRMP28827 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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PTPRMP28827 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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PTPRMP28827 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRMP28827 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRMP28827 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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