Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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