Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt27Q9Z320 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Krt27Q9Z320 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms