Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VarsQ9Z1Q9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms