Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms