Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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