Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms