Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms