Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms