Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn7Q9R1S8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn7Q9R1S8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms