Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx6Q9R1R0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms