Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms