Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp21Q9QZL6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp21Q9QZL6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp21Q9QZL6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Usp21Q9QZL6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp21Q9QZL6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Usp21Q9QZL6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Usp21Q9QZL6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms