Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc5Q9QX29 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms