Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms