Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bgrlQ9JJU8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bgrlQ9JJU8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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