Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bco1Q9JJS6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Bco1Q9JJS6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Bco1Q9JJS6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Bco1Q9JJS6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bco1Q9JJS6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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