Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
OtofQ9ESF1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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