Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms