Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms