Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpgrip1Q9EPQ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms