Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnft1Q9DCN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms