Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms