Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfn3Q9DAD6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn3Q9DAD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms