Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata1Q9D5R4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms