Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Krt20Q9D312 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Krt20Q9D312 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Krt20Q9D312 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt20Q9D312 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms