Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm16286Q9CQX6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms