Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP7

Trim33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, mousemouse

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim33Q99PP7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim33Q99PP7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms