Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms