Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lysmd3Q99LE3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lysmd3Q99LE3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms