Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PpifQ99KR7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpifQ99KR7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms