Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxp3Q99JB6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms