Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ApofQ91V80 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApofQ91V80 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms